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硕博培养
苏建忠
温州医科大学生物医学大数据研究所所长,瓯江实验室PI,国家“四青人才”,浙江省“杰出青年基金”获得者。开发在线算法工具和数据库10个,发表高水平SCI论文80余篇, 连续国家科技部重点研发项目, 国家自然基金重点子项目, 面上, 青年项目等课题。获省部级科研奖项2项,担任浙江省生物信息学会副理事长,中国生物信息学会(筹)重大疾病专委会副主任委员, 中国抗癌协会肿瘤标志物专业委员会委员,CCF生物信息专委会委员等学术职务

【科研项目】

1. 入选国家中组部人才项目,支持经费: 300万,2019.1.1-2021.12.31。

2. 国家自然科学基金重点项目: 先天性脊柱侧凸关键遗传调控网络的发现及机制研究 起止时间:2020,01-2024,12,300万元,子课题负责人

3. 浙江省自然科学基金杰青项目: 癌症表观基因组生物标志物识别研究 起止时间:2019,01-2022,12,73万元,项目负责人

4. 国家自然科学基金面上项目: 泛癌症异常DNA甲基化标志物识别及其调控机制研究 起止时间:2019,01-2022,12,63万元,项目负责人

5. 国家自然科学基金青年项目: 高通量DNA甲基化数据中识别功能组区域的算法研究 起止时间:2013,01-2015,12,27万元,项目负责人

6. 黑龙江省自然科学基金青年项目: 细胞分化过程表观遗传特征挖掘 起止时间:2012.01-2014.12,10万元,项目负责人

 

【学术成果】

  1. Ma Y*, Deng C*, Zhou Y*, Zhang Y, Qiu F, Jiang D, Zheng G, Li J, Shuai J, Zhang Y#, Yang J#, Su J#. Polygenic regression uncovers trait-relevant cellular contexts through pathway activation transformation of single-cell RNA sequencing data. Cell Genomics, 2023, 3(9):100383.(通讯作者)
  2. Liu Z*, Zhang Y*, Ma N*, Yang Y*, Ma Y*, Wang F, Wang Y, Wei J, Chen H, Tartarone A,  Velotta JB, Dayyani F, Gabriel E, Wakefield CJ, Kidane B, Carbonelli C, Long L#:, Liu Z#:, Su J#:, Li Z#:. Progenitor-like exhausted SPRY1+CD8+ T cells potentiate responsiveness to neoadjuvant PD-1 blockade in esophageal squamous cell carcinoma. Cancer Cell, 2023, S1535-6108(23)00327-6.(通讯作者)
  3. Zhao N*, Zhang Z*, Wang Q*, Li L*, Wei Z, Chen H*, Zhou M#, Liu Z#, Su J#. DNA damage repair profiling of esophageal squamous cell carcinoma uncovers clinically relevant molecular subtypes with distinct prognoses and therapeutic vulnerabilities. eBioMedicine, 2023, 96:104801.(通讯作者)
  4. Yu F*, Li  K*, Li S*, Liu J, Zhang Y, Zhou M, Zhao H, Chen H, Wu N, Liu Z#, Su J#: CFEA: a cell-free epigenome atlas in human diseases. Nucleic Acids Research 2020, Nucleic acids research 48 (D1), D40-D44.(通讯作者)
  5. Zhang X*#, Wang X*, Wang X, Su J#, Putluri N, Zhou T, Qu Y, Jeong M, Guzman A, Rosas C, Huang Y, Sreekumar A, Li W, Goodell MA: Dnmt3a loss and Idh2 neomorphic mutations mutually potentiate malignant hematopoiesis. Blood 2020, 135 (11): 845–856. (通讯作者)
  6. Su J#*, Yuan J*, Xu L*, Xing S*, Sun M*, Yao Y, Ma Y, Chen F, Jiang L, Li K, Yu X, Xue Z, Zhang Y, Fan D, Zhang J, Liu H, Liu X, Zhang G, Wang H, Zhou M, Lyu F, An G, Yu X, MAGIC, Xue Y#, Yang J# and Qu J#. Sequencing of 19,219 exomes identifies a low-frequency variant in FKBP5 promoter predisposing to high myopia in a Han Chinese population. Cell Reports, 2023, 42(5):112510.(通讯作者)
  7. Liu J#, Zhao H#, Zheng Y#, Dong L#, Zhao S#, Huang Y, Huang S, Qian T, Zou J, Liu S, Li J, Yan Z, Li Y, Zhang S, Huang X, Wang W, Li Y, Wang J, Ming Y, Li X, Xing Z, Qin L, Zhao Z, Jia Z, Li J, Liu G, Zhang M, Feng K, Wu J, Zhang J, Yang Y, Wu Z, Liu Z, Ying J, Wang X, Su J*, Wang X* and Wu N*. DrABC: deep learning accurately predicts germline pathogenic mutation status in breast cancer patients based on phenotype data. Genome Medicine, 2022, 14(1):21.(通讯作者)
  8. Liu J#, Zhao H#, Huang Y#, Xu S#, Zhou Y, Zhang W, Li J, Ming Y, Wang X, Zhao S, Li K, Dong X, Ma Y, Qian T, Chen X, Xing Z, Zhang Y, Chen H, Liu Z, Pang D, Zhou M, Wu Z, Wang X, Wang X*, Wu N* and Su J*. Genome-wide cell-free DNA methylation analyses improve accuracy of non-invasive diagnostic imaging for early-stage breast cancer. Molecular Cancer, 2021, 20(1):36. (通讯作者)
  9. Xu J*, Shi J*, Cui X, Cui Y, Li J, Goel A, Chen X, Issa J*, Su J#, Li W#, Cellular heterogeneity–adjusted clonal methylation (CHALM) provides better prediction of gene expression. Nature Communications, 2021, 12(1):400.  (通讯作者)
  10. Su J*#, Huang Y*, Cui X, Zhang X, Wang X, Xin Y, Lin Xue, Chen K, Lv J, Xu J, Goodell MA# and Li W#: Homebox oncogene activation by pan-cancer DNA hypermethylation. Genome Biology 2018, 19:108. (通讯作者)

 

【研究方向】生物医学大数据

 

【招生专业】生物医学工程

 

【联系方式】sujz@wmu.edu.cn